프로테오믹스 서비스에 대해 알아야 할 모든 것
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문의하기각 샘플 유형에 최적화된 프로토콜을 사용한 단백질 추출, 환원, 알킬화 및 트립신 소화.
C18 고체상 추출을 통한 염분 및 오염물질 제거.
데이터 의존적 획득(DDA)을 사용하는 Orbitrap Astral과 결합된 나노플로우 HPLC에서 90-120분 그라디언트.
FragPipe 또는 MaxQuant를 사용한 데이터베이스 검색, 단백질 및 펩타이드 수준에서 1% FDR 필터링.
라벨 프리 정량화(LFQ) 또는 동위원소 라벨링(TMT), 통계 분석, 경로 농축.
| 샘플 유형 | 식별된 단백질 | 식별된 펩타이드 |
|---|---|---|
| 인간 세포주 (1 μg) | 8,000-10,000 | 80,000-100,000 |
| 인간 조직 (10 mg) | 9,000-12,000 | 90,000-120,000 |
| 인간 혈장 (10 μL) | 500-800 | 5,000-8,000 |
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